Zavod za povijesne znanosti Hrvatske akademije znanosti i umjetnosti osnovan je kao Institut Jugoslavenske Akademije znanosti i umjetnosti u Zadru 1954. godine. Svrha osnivanja Akademijina Instituta/Zavoda bila je potreba sistematskog i intenzivnog istraživanja povijesti grada Zadra i njegove šire okoline, odnosno istraživanje i proučavanje prošlosti južne Hrvatske i posebno sjevernodalmatinskog područja. Akademijin Zavod je tijekom postojanja nekoliko puta mijenjao naziv. Od 1961. naziva se Institut za historijske i ekonomske nauke Jugoslavenske akademije znanosti i umjetnosti u Zadru, od 1974. Centar za znanstveni rad u Zadru a od 1978. Zavod za povijesne znanosti Istraživačkog centra Jugoslavenske akademije u Zadru. Uspostavom međunarodno priznate i neovisne Republike Hrvatske, od 1991. naziva se Zavod za povijesne znanosti Hrvatske akademije znanosti i umjetnosti u Zadru. U Zavodu se nalazi vrijedna Pomorska zbirka otvorena 1966., a u razdoblju od 1958. do 1981. djelovao je i Restauratorski atelje (radionica). Ovdje su restaurirane mnoge značajne i vrijedne crkvene i muzejske umjetnine. Zavod je posebno zaslužan za očuvanje kulturne baštine vrlo vrijednih umjetnina “Zlato i srebro Zadra“ i crkve i samostana sv. Marije u Zadru.
Znanstvena i kulturna djelatnosti Instituta, odnosno Zavoda, rezultirala je velikim brojem objavljenih znanstvenih i stručnih radova, te samostalnih publikacija. U proteklih šest desetljeća Zavod je bio organizator ili suorganizator preko pedeset znanstvenih i stručnih skupova, okruglih stolova, preko stotinu samostalnih javnih znanstveno-stručnih predavanja i raznih znanstveno-kulturnih događaja. Važno je naglasiti izdavačku djelatnost Zavoda, koji je u više od šezdeset godina rada postigao zavidnu razinu objavljenih i tiskanih publikacija.
